В Карелии качественной питьевой водой обеспечены 57,9% жителей, а число людей с доступом к хорошей воде уменьшилось на 7,3%. Регион сохранил второе место в антирейтинге субъектов с самыми грязными источниками централизованной питьевой воды.
Из 161 источника водоснабжения в республике почти 80% не соответствуют требованиям санитарных норм. Главная причина — износ сетей: по некоторым оценкам, более 70% водопроводов доведены до предела, и в трубы попадают ржавчина, механические примеси и другие вещества.
Сточные воды без очистки сбрасываются в озёра, откуда поступают в водопровод. Денег на реконструкцию и строительство канализационных очистных сооружений II категории по негативному воздействию на окружающую среду не хватает, поэтому для водоснабжения городов и посёлков активно используют поверхностные воды — реки и озёра, сильно подверженные загрязнению.
Для решения проблемы карельские учёные предлагают активнее использовать подземные воды для питья и перенести водозабор в открытые акватории Онежского и Ладожского озёр. В российском экологическом обществе предлагают создать «водный» фонд для сбора средств от промышленных предприятий на мониторинг и восстановление водных объектов.